位在台南市七股區的黑面琵鷺生態展示館，即是在黑面琵鷺保護區的保育管理中心，建物整體高架在潟湖上方，採綠建築型態設計，在屋頂或玻璃皆有防反光措施，避免傷到鳥類眼睛，並從黑面琵鷺生態展示館往海岸的步道，還設有賞鳥亭可漫遊其中。
黑面琵鷺生態展示館是台南第一座水上屋，也是台南市重要的環境教育設施場所，更是七股黑面琵鷺保護區的重要據點。黑面琵鷺生態展示館規劃設有常態展示區、多媒體室、特展區、會議室及戶外觀景平台，提供黑面琵鷺的詳細介紹與實際觀測的平台，因黑面琵鷺多會在9到10月抵達黑面琵鷺保護區，每到冬季午後總會有許多賞鳥遊客到此取景。
黑面琵鷺生態展示館除了提供黑面琵鷺的解說外，在外圍的蚵棚與魚塭也起到很好的生態教育作用，非常適合成為親子旅遊必踩的景點之一。記得如果有在黑面琵鷺生態展示館附近見到鳥類，請注意拍攝的快門音量與閃光燈，這些都會驚擾到鳥類，並且閃光燈嚴重可能會使鳥類失明。此外，鄰近景點還有七股鹽田、七股潟湖、觀海樓、鹿耳門聖母廟等等地點能夠參觀。
