位處台南市白河區的碧雲寺，開山源自於尋晚年隱修之所的李應祥，在枕頭山南腰找到「半壁吊燈火」的麒麟穴，相傳是最為適合靈修參禪的所在，後李應祥從大仙寺請回觀音聖像於此坐鎮，而真正修建廟宇之時，在一次9人應試登科的神蹟，為感佩觀音聖像保佑，於是合資將開墾之地捐作寺產，並逐步興建廟宇群，才有今日之碧雲寺。
打從自大仙寺請回觀音聖像，碧雲寺便歷經多次改建，還曾於地震時摧毀，後來甚至因寺方無人管理導致荒廢，最種因信徒極力爭取才又重建，蔣介石曾親臨碧雲寺，並賜匾額「凌宵寶殿」，現已被列為三級古蹟。碧雲寺的建築群遍佈佛、道教與台灣民間傳統信仰的痕跡，廟宇建築以台閩與日式混合為主要風格，忠實呈現極富歷史意涵的碧雲寺。
碧雲寺最大的特色是其與水火同源承屬一脈，地底都蘊藏豐富的天然氣，並碧雲寺地處關子嶺風景區內高海拔區域，遠眺視野極佳，寺廟氛圍因處深山內也較為寧靜，於此漫遊能獲得真正的放鬆。而傳說中會有源源不絕米糧的出米洞就在門口的左側，後山壁設有龍泉水能夠取用，寺後山也有風動石的呼嘯之音。水火同源就在碧雲寺的五公里處。
